Τα Windows XP χρησιμοποιούνται κυρίως
NTFS (σύστημα νέας τεχνολογίας αρχείων) , αν και θα μπορούσε επίσης να υποστηρίξει
FAT32 (Πίνακας κατανομής αρχείων 32) . Το NTFS ήταν το προεπιλεγμένο και το συνιστώμενο σύστημα αρχείων για τα βελτιωμένα χαρακτηριστικά του όπως η ασφάλεια και η μεγαλύτερη υποστήριξη μεγέθους αρχείων.