Το CBR600RR δεν διαθέτει ειδική εργαλειοθήκη με την παραδοσιακή έννοια όπως κάποιες άλλες μοτοσικλέτες. Τα εργαλεία συνήθως αποθηκεύονται κάτω από το κάθισμα, συχνά σε ένα μικρό διαμέρισμα ή απλά τοποθετημένα στο διαθέσιμο χώρο. Μπορεί να τους βρείτε χαλαρά συσκευασμένα ή σε μια μικρή τσάντα. Δεν υπάρχει καθορισμένο, κλειδωμένο διαμέρισμα.