Ένα σημαντικό μέρος του λογισμικού συστήματος είναι το
λειτουργικό σύστημα (OS) . Το λειτουργικό σύστημα διαχειρίζεται όλους τους πόρους υλικού και λογισμικού ενός συστήματος υπολογιστή. Ενώ υπάρχουν και άλλα εξαρτήματα (όπως τα προγράμματα οδήγησης συσκευών, το BIOS/UEFI κ.λπ.), το λειτουργικό σύστημα είναι αναμφισβήτητα το πιο κρίσιμο, καθώς αποτελεί το θεμέλιο πάνω στο οποίο εκτελείται όλο το άλλο λογισμικό.