Το αρχικό DOS χρησιμοποίησε το
λίπος (πίνακας κατανομής αρχείων) Σύστημα αρχείων. Οι μεταγενέστερες εκδόσεις του DOS θα μπορούσαν επίσης να υποστηρίξουν το HPFS (σύστημα αρχείων υψηλής απόδοσης), αλλά το λίπος ήταν το κύριο και πιο κοινό σύστημα αρχείων.