Το MS-DOS δεν έχει "λογισμικό" με τον τρόπο που μια σύγχρονη εφαρμογή μπορεί. Το κέλυφος MS-DOS * είναι * το λογισμικό. Είναι ο διερμηνέας γραμμής εντολών. Είναι αυτό που χειρίζεται την είσοδο των εντολών (όπως το `dir`,` copy`, `format ') και τα εκτελεί. Δεν υπήρχε ξεχωριστό πρόγραμμα * τρέξιμο * το κέλυφος. Το κέλυφος * ήταν * το κύριο περιβάλλον χρήστη του λειτουργικού συστήματος. Τα βασικά αρχεία που είναι υπεύθυνα για αυτό είναι `command.com` (σε προηγούμενες εκδόσεις) ή` io.sys` και `msdos.sys` (που συνεργάζονται σε μεταγενέστερες εκδόσεις). Αυτά τα αρχεία δεν είναι εφαρμογές από μόνα τους, αλλά αποτελούν το θεμελιώδες λογισμικό που αποτελεί τη λειτουργικότητα του κελύφους MS-DOS.