Η αρχιτεκτονική της CPU είναι πιο συμπληρωματική με το MS-DOS είναι η Αρχιτεκτονική
x86 . Το MS-DOS σχεδιάστηκε κυρίως και έτρεξε σε επεξεργαστές Intel X86 (και αργότερα συμβατούς επεξεργαστές από την AMD κ.λπ.). Παρόλο που θα μπορούσε θεωρητικά να τρέξει σε άλλες αρχιτεκτονικές με εξομοίωση, σχεδιάστηκε για και αναπτύχθηκε στο X86.