Το μέγιστο υποστηριζόμενο μέγεθος μονάδας δίσκου των Windows 98 είναι
128 GB . Ωστόσο, αυτό είναι ένα θεωρητικό όριο και συχνά απαιτεί τη χρήση οδηγών ή λύσεων τρίτων για να το επιτύχει. Χωρίς τέτοιες λύσεις, το πρακτικό όριο είναι σημαντικά μικρότερο, συνήθως περίπου 2 GB έως 4 GB, ανάλογα με το σύστημα διαχωρισμού.